向云在接到朝廷旨意后，在广宗停歇了一夜，便率麾下三千五百精锐，带上充足粮草，向东郡出发了；面对如今的向云，董卓已不敢为难，如今的向云虽然官职比董卓低一级，但却不是他麾下将领，不归他管，又手握实权，自然不敢轻易得罪，况且如今天下尚未真正大乱，董卓亦不敢轻举妄动。

接下来，一切便顺利许多，向云率麾下经一段时间赶到东郡，与卜已大战几场，向云兵精将勇，猛将无数，即使人数处于劣势，却是次次大胜而归，黄巾奈何不得，几场下来，反而折掉不少人手，卜已也学聪明了，不与向云纠缠，或是据城而守，或是遇到便跑，总之就是不与向云交战，向云兵少，舍不得拿来攻城，也无法彻底对卜已造成毁灭姓打击，就此，一时间向云也奈何不了卜已，卜已也拿向云没辙。

不过，这种情况随着皇甫嵩大军到来而不攻自破。

七月，皇甫嵩在南阳与朱儁联合，使诱敌之策，斩杀张曼成、赵弘，大败南阳黄巾，剩下韩忠、孙夏之流逃到宛城，这边，朝廷知晓向云兵少，得知南阳黄巾张曼成被斩，则令皇甫嵩率大军与向云汇合，朱儁则继续率本部人马攻打宛城。

八月，皇甫嵩、向云联合，大败卜已于苍亭，斩杀黄巾兵五千余人，卜已被擒，逃散者无数。自此，经过近一月时间，东郡黄巾平定。

就在官军呈一片大好之势时，东中郎将董卓兼并卢植本部后，合军近万，围张燕于癭陶，就在众人以为张燕即将被灭时，结果却是出乎预料。

在董卓包围癭陶当曰，张燕利用董卓的轻视，于当夜率军袭营，大败官军，董卓落荒而逃，却是连连走入张燕陷阱，要不是最后靠着刘关张三人勇猛，将董卓救出，恐怕董卓便死于这场袭营中，面对救命恩人，董卓却是没有对待救命恩人的觉悟，在得知刘备还是白身后，董卓一声冷哼，不再理会刘备，刘关张气急，愤然而去。

此役，黄巾张燕大胜，斩杀官军四千，逃散者无数，董卓大败而归，最后收拢残兵，竟只剩三千余人，董卓欲哭无泪。

帝刘宏得知消息后，天颜大怒，免除了董卓东中郎将职位，命左中郎将皇甫嵩与虎威将军向云合兵万余，继续北上，攻取张燕。

在北上途中，向云、皇甫嵩遇到愤然而去的刘关张，几人见面，一番感慨不说，在向云邀请下，三人再次投入向云麾下，与向云、皇甫嵩一同前往癭陶。

癭陶，张燕得知皇甫嵩与向云联合来袭，大惊，董卓他并不放在眼里，但是这二人随便拿出一个，他都的掂量掂量，一个是大破汝南黄巾波才，及南阳黄巾的皇甫嵩，一个大破广宗，斩杀张角三兄弟的向云，这二人，在张燕眼里，就是十个董卓叠一起也比之不过。

张燕麾下虽号称十万大军，但他却知道这十万大军有多少水分，在皇甫嵩与向云未到之前，张燕无奈的做出了一个明智的决定，率十万大军撤离癭陶，退往深山，十万黄巾往山里躲去，官军再也找不到人影。

张燕不攻自破，这个结果，让本以为又要一场大战的人们大跌眼镜，自此，皇甫嵩名望再次高涨。

十一月，南阳宛城黄巾，因主力被歼，危城不守，余部在韩忠、孙夏率领下向西鄂附近精山转移，朱儁率军追击，孙夏等万余人战死，南阳黄巾平定，大军班师回朝。

而这场历时上最大的农民起义，也而宣布正式平定。

黄巾平定，有功之士论功行赏，皇甫嵩被封左车骑将军，领冀州牧，并晋封他为槐里侯，食槐里、美阳两县，共八千户；朱儁封右车骑将军，朱儁率兵回京，任命为光禄大夫，增邑五千，改封钱塘侯，加位特进；刘备被封安喜县县尉，除此之外，还有其他大小将领封赏不谈。